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錳是葉綠體的組成物質(zhì)，直接參與光合作用，在葉綠素合成中起催化作用。是許多酶的活化劑，還可以影響激素的水平。錳對酶的活化作用與鎂相似，大多數(shù)情況下可以互相代替。根中硝酸還原過程不可缺少錳，因而錳影響硝態(tài)氮的吸收和同化。

果樹缺錳時，葉綠體中錳的含量顯著下降，結(jié)構(gòu)也發(fā)生變化，光合作用明顯受到抑制，使葉片失綠或呈花葉。蘋果缺錳時，葉脈間失綠，淺綠色，有斑點，從葉緣向中脈發(fā)展；嚴重缺錳時，脈間變褐色并壞死。

錳過多時能抑制三價鐵還原成二價鐵，降低鐵的生理活性，樹體表現(xiàn)缺鐵失綠癥狀，還易引發(fā)蘋果粗皮病。

石灰性土壤、通氣良好的輕質(zhì)土壤，以及山坡頂部的土壤，錳的有效性較低，易表現(xiàn)缺錳癥狀。酸性土壤、黏重土壤、山根土壤，以及易積水的土壤，錳的有效性高，易表現(xiàn)多錳癥狀。