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牡蠣對食物僅有物理性的選擇能力，即只能選擇食物顆粒的大小，而對食物的化學(xué)性，除了一些特別有害的刺激物質(zhì)之外，一般沒有選擇能力。因此，牡蠣胃含物中的食物種類和數(shù)量組成，在很大程度上取決于周圍環(huán)境海水中的食料變化。此外，牡蠣在幼蟲期和成體時由于消化器官的發(fā)育程度不同，其食料種類和食料顆粒大小也有明顯差別。

牡蠣從受精卵發(fā)育至面盤幼蟲這一階段，胚體不從外界攝取營養(yǎng)，其能量靠體內(nèi)的卵黃物質(zhì)供給。面盤幼蟲以后開始從外界攝取營養(yǎng)，但由于幼蟲階段濾食器官發(fā)育不夠完善，因此，只能攝食一些較小的顆粒。人工培育牡蠣幼蟲的情況表明，金藻、小球藻、三角褐指藻、扁藻等單細胞藻類，都是牡蠣幼蟲的良好餌料。在人工培育牡蠣幼蟲時，將幾種單細胞藻混合投喂，對促進幼蟲的生長發(fā)育，效果更好。

牡蠣成體的食料，主要是硅藻類及有機碎屑。其中，尤以直鏈藻、圓篩藻、海鏈藻和舟形藻為多。如前所述，牡蠣除對食物顆粒的大小有選擇外，對食物是否具有食用價值是沒有選擇能力的。有時，在牡蠣的胃和消化道中可以發(fā)現(xiàn) -些不能消化的顆粒物質(zhì)，就說明了這一點。

此外，牡蠣食料的種類因海區(qū)不同而變化。在有些海區(qū)，自然存在的有機碎屑的數(shù)量常多于浮游生物的量，而成為當(dāng)?shù)啬迪牭闹饕沉?。但是，在自然分布浮游硅藻量多的海區(qū)，牡蠣所攝食的餌料種類就必然是以硅藻為主。