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活魚在密集運輸過程處于一種非常惡劣的環(huán)境中，交通工具的顛簸，水的震蕩，水中溶氧的缺乏，有毒排泄物的增加，二氧化碳的增多及與之相關(guān)的pH值的降低，在水震蕩下，魚類的劇烈運動和撞碰受傷，這些都會導(dǎo)致魚類的生理失調(diào)，造成運輸過程中的大量傷亡。魚在運輸中的死亡是復(fù)雜的綜合作用，很難說是哪個單一因子引起的。但死魚的主要原因可能有以下幾方面。

(1)運輸中魚的密度大，活動強烈，使溶氧含量降低，二氧化碳、氨等有毒的排泄物增加。但在運輸中一般都采取增氧措施，溶氧缺乏不一定是死魚的主因。氨量雖大，但因為pH值較低，毒死魚的可能性也很小。

(2)魚體在運輸中撞碰受傷后，淡水可以通過傷口大量進入魚體，超過腎臟排泄的能力，使魚體內(nèi)水分平衡失調(diào)。傷口還會感染水霉菌病，使魚在運輸后死亡。

(3)由于魚的劇烈活動，供應(yīng)能量時糖分解不完壘，肌肉內(nèi)乳酸的積累量超過魚類所能忍受的限度而引起死亡。

(4)途中補水不當(dāng)，加入了有毒的污水或含氯量太高的自來水。據(jù)報道，自來水的含氯量為0.25-0.3毫克／升時，有一部分魚苗死亡，達0.35毫克／升時，全部死亡。

(5)在運輸前忽視了對魚種的鍛煉，造成了魚種大批死亡。根據(jù)實踐經(jīng)驗，我國的鰱、鳙等魚苗、魚種，在運輸前必須拉兩三次網(wǎng)再放入魚池，叫做鍛煉，鍛煉過的魚能忍耐長途運輸。

(6)在運輸魚苗時忽視了魚苗的孵出時間，過嫩的魚苗卵黃囊還未消失，鰾（腰點）未出現(xiàn)，魚苗不會浮起，放入水中，就會沉到水底，陷入缺氧的淤泥中，造成死亡，因而不能運輸，孵出過久，很難得到適口餌料，體色發(fā)黑，也不好運輸。只有在鰾剛出齊，體呈淡黑色的魚苗才適宜運輸。

(7)運輸前忽視了魚苗質(zhì)量的檢查。如果魚體瘦弱，就經(jīng)不起運輸過程中環(huán)境的驟變，造成大部或全部死亡。